MICROARRAYS

L’étude du transcriptome global par microarrays (ou puces à ADN) permet d’obtenir un profil (qualitatif et quantitatif) de l’expression des gènes d’un échantillon (cellules, tissus, biopsies) à un moment donné ou dans une condition physiologique ou pathologique déterminée. Ce profil constitue dès lors une caractéristique intrinsèque à l’échantillon rendant possible de nombreuses applications :  découverte de nouvelles cibles  thérapeutiques, recherche de biomarqueurs, étude de mécanismes d’action ou de voies de signalisation, connaissances fondamentales…

Bioalternatives, service provider Affymetrix®, vous propose des prestations d’analyses transcriptomiques par microarrays (technologie des puces à ADN) basées sur l’utilisation de la plate-forme GeneAtlas®.

Microarrays

Parmi les microarrays de la gamme Affymetrix, nous proposons :

  • Human Genome U219 Array Stripmw_Affy geneatlas_arraystrips
  • Human Genome U133+ PM Array Strip
  • Rate Genome-230 PM Array Strip
  • Mouse Genome-430 PM Array Strip
  • Human Gene ST Array Strip
  • Rate Gene ST Array Strip
  • Mouse Gene ST Array Strip
  • Canine Gene ST Array Strip
  • Feline Gene ST Array Strip
  • miRNA Array Strip

En plus de rendre possible l’analyse d’expression de gènes à l’échelle du transcriptome entier, Bioalternatives vous propose l’analyse des micro-RNA grâce à la puce miRNA 4.1 dédiée à la détection de ces ARN non codants de petite taille.

Des système Gene Array Strip sont également disponibles pour la réalisation d’études à partir d’échantillons issus d’autres organismes. Consultez-nous !

Microarrays, analyses et services associés

Nos prestations d’analyses sur microarrays incluent :

  • la préparation ou la récupération des échantillons biologiques
  • l’extraction des ARN et leur contrôle qualité par électrophorèse capillaire (Agilent)
  • l’hybridation sur microarrays
  • le scanning
  • la génération des données brutes au format CEL
  • le contrôle qualité et la normalisation des données

avec en option des services complémentaires d’analyse bioinformatique et d’exploitation de données :

  • une analyse standard des données (calcul de fold change et analyse statistique)
  • une analyse fonctionnelle basique : comparaisons inter-groupes et étude des processus biologiques modulés (DAVID, IPA)
  • une analyse fonctionnelle avancée comprenant un clustering et une identification des gènes-cibles et/ou des voies de signalisation modulées (IPA)

mw_Affy Scatter Plot

mw_Affy Inflammatory responsemw_NF-kB-signaling-pathway-affymetrix

Related Posts or publications

Extraction d’ARN et contrôle qualité Une extraction réalisée dans de bonnes conditions permettra d’obtenir des échantillons d’ARN de bonne qualité qui garantiront le succès des expériences en aval.
hybridation in situ d’acides nucléiques L’hybridation in situ est une technique qui permet de visualiser la présence d’ADN ou d’ARN spécifiques à l’intérieur d’une cellule ou d’un tissu. Le principe de cette technique est basé sur l’utilisation d'une sonde fluorescente correspondant à une ...
Méthodes d’analyse des miRNA Bioalternatives propose différentes solutions pour l’analyse des microARN. Une analyse du profil d’expression complet des microARN (miRNome) à partir d’une puce à ADN/microarray permettra la mise en évidence de signature moléculaire et l’identificati...
Expression de gènes par PCRarrays Dédiés aux analyses d'expression de gènes par PCR quantitative, on appelle PCRarrays le regroupement d'une sélection de primers autour d'une thématique ou d'un processus biologique donné. La mise en œuvre d'analyses d'expression de gènes par PCRarray...
Bioinformatique : exploitation basique et fonctionnelle des données Prestations de bioinformatique dédiées à l'analyse et l'exploitation des données transcriptomiques : traitement des données brutes, contrôle qualité, normalisation, analyses statistiques, analyse fonctionnelle basique et exploitation avancée (cluster...